在处理合同纠纷时，双方赔偿协议中通常会明确规定争议解决的方式。然而，有时协议中可能未明确提及仲裁条款，或者相关条款表述不够清晰。在这种情况下，是否可以进行仲裁需要根据具体情况和相关法律规定来判断。

首先，需要明确的是，仲裁作为一种替代性争议解决机制，在许多情况下被视为解决合同争议的有效途径。它允许双方在争议发生时选择一个独立的第三方机构或个人来裁决争议。然而，是否能够通过仲裁解决争议取决于双方之间的协议内容以及适用的法律。

如果双方赔偿协议中没有明确提及仲裁条款或该条款表述模糊不清，那么是否可以进行仲裁取决于以下几个方面：

1. **协议的意图**：法院会审查双方在签订协议时的真实意图。如果证据表明双方有意通过仲裁解决争议，则即使条款不明确也可能支持仲裁。

2. **适用法律**：不同国家和地区对于此类问题有不同的法律规定。例如，在一些国家和地区，即使合同中没有明确提到仲裁条款，只要符合特定条件（如满足公平合理原则），法院可能会承认并支持仲裁。

3. **具体案件情况**：每个案件的具体情况不同，法院或仲裁机构可能会根据具体案情作出裁决。

总之，在遇到类似情况时，建议咨询专业律师以获得具体法律意见。律师可以根据具体情况提供专业建议，并帮助当事人更好地理解其权利和义务。同时，在签订任何涉及赔偿和争议解决方式的合同时，确保所有条款清晰、完整，并考虑加入明确的仲裁条款以避免未来可能出现的不确定性。