在探讨5000元的工资是否可以按照3500元的基数缴纳社保之前，我们需要先对社保缴纳基数进行深度理解。

社保缴纳基数是指计算社会保险费时所依据的工资标准。根据我国相关法律法规，用人单位应当按照职工上一年度月平均工资作为缴费基数来缴纳社会保险费。然而，在实际操作中，很多地区允许用人单位和职工协商确定一个低于实际工资水平的缴费基数，但这一基数不能低于当地规定的最低缴费基数。

以5000元的工资为例，如果当地规定的最低缴费基数为3500元，则理论上是可以按照3500元的基数来缴纳社保的。但是，这样做可能会带来一些潜在的问题。

首先，从法律角度来看，这种做法可能被视为规避法律义务的行为。根据《社会保险法》规定，用人单位应当按时足额缴纳社会保险费，并且职工个人也需要按规定缴纳相应的部分。如果用人单位选择较低的缴费基数，可能会导致员工的实际权益受损。

其次，从长远来看，较低的缴费基数可能会影响员工未来的养老保障水平。因为养老金计算与个人累计缴费年限和缴费基数密切相关。如果长期使用较低的缴费基数进行缴纳，那么将来领取到的养老金可能会低于实际应得金额。

综上所述，在选择按较低基数缴纳社保时需谨慎考虑其潜在风险，并尽可能选择合理的缴费基数以保障自身权益。