原子与分子是物质的基本构成单元，两者之间既有联系也有区别。理解它们之间的联系和区别，有助于我们更好地认识物质的微观结构和宏观性质。

原子是化学元素的基本单位，由原子核和围绕原子核运动的电子组成。原子核内含有质子和中子，质子带正电荷，中子不带电荷。电子则带有负电荷，并且质量远小于质子和中子。原子的质量主要集中在原子核上。原子通过电子在不同能级上的排列表现出不同的化学性质。

分子是由两个或两个以上原子通过化学键结合而成的稳定粒子。分子中的原子通过共价键、离子键或金属键等方式相互连接。分子的大小、形状以及化学性质取决于构成它的原子种类及其排列方式。分子间可以存在范德华力等相互作用力，这些作用力影响着物质的物理性质。

原子与分子之间的联系主要体现在以下几个方面：

1. **构成物质的基础**：无论是固体、液体还是气体，都是由大量分子组成的，而每个分子又是由一个或多个原子构成的。

2. **化学反应的本质**：在化学反应中，参与反应的是分子中的原子，而不是整个分子。反应过程中，旧的化学键断裂，新的化学键形成。

3. **物理性质**：物质的许多物理性质（如熔点、沸点等）不仅取决于其组成元素的特性，还与其分子结构密切相关。

两者之间的区别在于：

1. **基本组成单元**：原子是最小的保持元素特性的单位；而分子是由两个或更多个相同或不同的原子通过共价键连接而成。

2. **稳定性**：单独存在的简单非金属元素（如氢气）以分子形式存在；而金属元素通常以单个原子形式存在。

3. **化学反应过程**：在化学反应中，通常涉及的是分子内部的共价键断裂和形成；而在某些情况下（如金属间的置换反应），也可能会涉及单个金属离子的变化。

4. **物理状态**：大多数情况下，气体由独立的分子组成；液体和固体则含有密集排列在一起的大量分子。

综上所述，虽然原子与分子在物质结构上紧密相连，但它们各自具有独特的特征和功能，在科学研究和技术应用中扮演着重要的角色。