常熟到南京的最晚一班客车发车时间通常在晚上10点左右。具体发车时间可能会根据不同的客运公司和运营情况有所调整。建议乘客提前通过官方网站或电话查询最新的班车时刻表，以确保能够顺利出行。同时，考虑到可能遇到的交通状况或其他不可预见的因素，建议乘客预留足够的时间前往车站，并提前到达以避免错过班车。